Wadium w 2 minuty
Uzyskaj wadium bez dokumentów i odchodzenia od komputera, w 3 krokach:
kliknij podaj dane opłać online
Sprawdź, jak to zrobić - Film
Postępowanie ID: 379707 :
138254 Usługa sekwencjonowania NGS (next generation sequencing) polegającą na sekwencjonowaniu prób DNA oczyszczonych przy pomocy techniki immunoprecypitacji chromatyny oraz próbek kontrolnych typu input (metoda ChIP-seq)) i obróbce bioinformatycznej wyników sekwencjonowania.
Wystawiający
-
UżytkownikDorota Wiśniewska
-
Organizacja
-
OddziałDział Obsługi Zakupów
-
Wiadomość do zamawiającego
Terminy
-
Zamieszczenia2020-09-22 12:58:00
-
Składania2020-10-02 12:57:00
-
Otwarcie ofert-
-
Tryb
-
RodzajUsługa
Wymagania i specyfikacja
Szanowni Państwo, Serdecznie zapraszamy do składania ofert w na usługę sekwencjonowania NGS (next generation sequencing) polegającą
na sekwencjonowaniu prób DNA oczyszczonych przy pomocy techniki immunoprecypitacji chromatyny oraz próbek kontrolnych typu input (metoda ChIP-seq)) i obróbce bioinformatycznej wyników sekwencjonowania.
Zastrzegamy, że postępowanie może zakończyć się brakiem wyboru oferty w przypadku przekroczenia szacowanych środków.
Opis zamówienia:
1. Badanie zgodne z opisem z załącznika - Opis zamówienia
2. Planowane ilości oznaczeń do wykonania mogą ulec zmianie w ramach zaplanowanej kwoty przeznaczonej na wykonanie badania. Zamawiający nie jest zobowiązany do wykorzystania całej zaplanowanej wartości zamówienia.
3. Termin wykonywania badań może się wydłużyć lub ilość oznaczeń zwiększyć jeśli nie zostanie wykorzystana cała kwota przeznaczona na wykonanie zamówienia.
4. Warunki płatności: 30 dni od otrzymania przez Zamawiającego poprawnie wystawionej faktury.
O udzielenia zamówienia mogą ubiegać się Wykonawcy, którzy spełnią warunki udziału w postępowaniu wymienione w punkcie 8 załącznika. Wymagany komentarz do każdego punktu.
W punkcie 13 prosimy o u zupełnienie ceny jednostkowej - będzie konieczna przy wyliczeniach w przypadku zwiększenia lub zmniejszenia zamówienia
W przypadku pytań:
- merytorycznych, proszę o kontakt za pośrednictwem przycisku w prawym, dolnym rogu formularza "Wyślij wiadomość" lub pod numerem telefonu: dr Urszula Oleksiewicz, u.oleksiewicz@gmail.com,
tel: +48 61 854 76 35
- związanych z obsługą platformy, proszę o kontakt z Centrum Wsparcia Klienta platformy zakupowej Open Nexus pod nr 22 101 02 02, czynnym od poniedziałku do piątku w godzinach 7:00 do 17:00.
Oficjalnym potwierdzeniem chęci realizacji zamówienia przez Zamawiającego jest wysłanie zamówienia lub podpisanie umowy.
Zamawiający odrzuci ofertę, jeżeli:
a) treść oferty nie odpowiada treści zapytania ofertowego;
b) oferta został złożona przez Wykonawcę wykluczonego z postępowania,
c) jest nieważna na podstawie przepisów prawa.
Załączniki do postępowania
Komunikaty Wyślij wiadomość do zamawiającego
|
2020-09-24
14:55:34
|
Dorota Wiśniewska |
Pytania
firmy
MACROGEN
wraz
z
opowieziami
z
dnia
24.09. Szanowni Państwo, W związku z opublikowaniem oferty o numerze ID 379707 w serwisie platformazakupowa.pl dotyczącym sekwencjonowania Chip-Seq, chciałbym zadać następujące pytania: Pkt. 5 załącznika do zamówienia 138254 - w jakiej objętości dostarczone zostaną próbki? ODP: Od 50 do 300ul. 2. Pkt. 7 Czy zamawiający gwarantuje, iż kolejna partia próbek spełni wymagania jakościowe? Jeśli nie, koszty ilu kolejnych transportów ma pokryć wykonawca (e.g. w sytuacji, gdy pierwsza dosyłana partia nie spełnia wymogów)? ODP: Nie mamy takiej gwarancji. Natomiast zgodnie z zapewnieniem producenta zestawu odczynników użytych do ChIP, bufor do zawieszania oczyszczonego DNA jest kompatybilny z NGS. Zakres fragmentów DNA po sonikacji znajduje się w w obrębie 100-500bp. Zakładamy potencjalną 1 dodatkową dosyłkę. 3. Pkt. 8 pozycja 8 Differential enrichment analysis- jaki jest przyjęty układ eksperymentalny (e.g. 6 grup badanych, 5 porównań między grupami)? ODP: Układ eksperymentalny dotyczy 6 grup badanych (1 kontrola typu wild Typ + 5 prób z nadekspresją różnych czynników transkrypcyjnych) oraz 5 porównań (każdy czynnik transkrypcyjny porównany do próby wild type). 4. Pkt. 8 pozycja 9: czy zamawiający pisząc "peak annotation (sąsiadujących genów, miejsc TSS, TTS, 5’UTR, 3’UTR, gene body, odległość od promotora) ma na myśli analizę zobrazowaną w postaci dołączonego pliku? ODP: Zamawiający pisząc „peak annotation” ma na myśli analizę przesłaną w formie tabularyczną (lista peak’ów wraz z odpowiadającą im annotacją) oraz ogólne zobrazowanie – ile peaków przypada na konkretną annotację. 5. Pkt. 9 Ze względu na wymaganą zaawansowaną analizę bioinformatyczną wymagającą znacznych mocy obliczeniowych- czy zamawiający zgadza sie na wydłużenie terminu realizacji do 10 tygodni od dnia pozytywnego zakwalifikowania próbek pod kątem jakościowym i ilościowym? ODP: Tak, jest możliwe wydłużenie realizacji zamawianej analizy, tak aby ona jak najwyższej jakości. 6. Pkt. 13 Wymagana analiza bioinformatyczna obejmuje porównanie określonej ilości grup, a liczba grup do porównania to wartość zmienna, podyktowana końcową ilośćią próbek. Czy zamawiający zgadza się założyć, iż prób będzie 24, grup do porównań 6, a samych porównań 5 (tak jak sugerowane jest przez zamierzaną ilość prób)? ODP: Tak. 7. Pkt. 16 pozycja 1: - Prosimy o zmniejszenie zapisu o karze z 10% na 5%. ODP: Tak 8. Pkt 16 pozycja 2: - Prosimy o zmniejszenie zapisu o karze za opóźnienia w wykonaniu umowy z 0,05% na 0,01%. Prośba wynika z faktu, iż za potencjalne opóźnienia w płatnościach wykonawca może naliczać jedynie odsetki ustawowe, toteż powstaje asymetryczność w traktowaniu stron ewentualnej umowy. ODP: tak 9. W zwiazku z licznymi pytaniami prosimy o wydłużenie czasu składania ofert o kilka kolejnych dni roboczych. ODP: Czas składania ofert zmieniono na 02.10.2020 |
